Первые его работы по истории права: "Опыты по истории юрисдикции налогов во Франции с XIV века до смерти Людовика XIV" (М., 1877);
"История полицейской администрации в английских графствах с древнейших времен до смерти Эдуарда I" (Прага, 1877, магистерская диссертация);
"Полиция рабочих в Англии в XIV веке и мировые судьи, как судебные разбиратели споров между предпринимателями и рабочими" (Л., 1876);
"Общественный строй Англии в конце средних веков" (М., 1880, докторская диссертация). К этому же времени относятся: "Очерк истории распадения общинного землевладения в кантоне Ваадт" (Л., и немецкое изд. Цюрих, 1876); "Общинное землевладение, причины, ход и последствия его разложения" (М., 1879), а также методологический этюд "Историко-сравнительный метод в юриспруденции и приемы изучения истории права" (М., 1880).
"Современный обычай и древний закон. Обычное право осетин в историко-сравнительном освещении" (М., 1886; переведена на французский, 1893);
"Закон и обычай на Кавказе" (М., 1887); "Tableau des origines de l'evolution de la famille et de la propriete" (Стокгольм, 1890; русский перевод, СПб., 1895);
"Современный обычай и древний закон в России" (лекции, читанные в Оксфорде и напечатанные по-английски);
"Этюды по русскому обычному праву" (в "Nouvelle Revue historique du droit", на французском языке).
С 1895 года начинает выходить капитальное сочинение Ковалевского по истории права "Происхождение современной демократии", ныне законченное (пять томов; первый том вышел третьим изданием в совершенно переработанном виде); в этом исследовании, некоторые части которого изданы отдельно на французском языке ("Падение венецианской республики"; "Села и города накануне французской революции"), Ковалевский ставит себе задачей выяснить развитие демократических теорий в связи с историей общественного и политического уклада Западной Европы со времен французской революции.
Вопросам социологии посвящены: "Современные социологи", "Социология" (2 тома) и ряд статей: "О дарвинизме в социологии", "Современные социологи Франции", "Прогресс", "Генетическая социология" (в "Итогах Науки"), "Социологический очерк истории государства" (том XIV, 534 - 70, настоящего "Энциклопедического словаря"). Другие труды Ковалевского: "Происхождение мелкой крестьянской собственности во Франции", "История Великобритании" (обширная статья, составляющая целую монографию, в "Энциклопедическом словаре" Товарищества Гранат), ряд работ по истории политических учений: "От прямого народоправства к представительству и от патриархальной монархии к парламентаризму" (3 тома, неоконч.), "О политической доктрине Мильтона" и "О Спенсере и Марксе (две жизни)" - в "Вестнике Европы". Важнейшим своим сочинением сам Ковалевский считает "Экономический рост Европы в период, предшествующий развитию капитализма" (на русском языке вышли 3 тома, в немецком издании, недавно законченном, вышло 7 томов). В этом труде Ковалевский следит за историей землевладения на Западе, начиная с эпохи упадка Римской империи и родового быта германских племен, до появления современного земельного уклада, с преобладанием частной собственности и фермерского хозяйства. Параллельно с этим излагается и история развития промышленности как в поместьях, так и в городах, с развития цехового хозяйства до момента полного обособления предпринимателей от простых исполнителей, - а также история рабочего вопроса на Западе, в связи с разными попытками регламентации заработной платы.
В бытность профессором Московского университета, Ковалевский принимал самое живое участие в издававшемся им, вместе с профессором Вс. Миллером, научном журнале: "Критическое обозрение", сыгравшем крупную роль в жизни ученой Москвы того времени; тогда же он издал "Собрание актов и документов, служащих к характеристике английской полицейской администрации XII, XIII и XIV веков" (Л., 1877). Он редактировал также итальянское издание депеш венецианских послов о событиях французской революции. Наряду с чисто научной деятельностью Ковалевским выдвигается, в особенности за последние годы, публицистическая деятельность его. В 1906 - 1907 годах под редакцией его и И.И. Иванюкова выходила газета "Страна", а с 1909 года он является издателем "Вестника Европы" и заведует в нем отделом общественных и юридических наук. За это время он напечатал целый ряд статей по текущим вопросам внутренней и внешней политики России. Им издан на французском языке ряд работ, посвященных ознакомлению Запада с экономическим бытом России, с историей ее политических учреждений, с пережитым ею кризисом 1905 - 1906 годов, с социальным законодательством России со времени обновления ее политического строя. Некоторые из этих работ появились ранее на английском языке.
Ковалевский принимает также участие в издании двух энциклопедических словарей: Брокгауза - Ефрона и Тов. Гранат, для которых им написан целый ряд статей.
